В мире данного аниме все маги рождаются с меткой на руке и главный герой не является тому исключением. Когда-то жил великий маг Гайас (Гай), родившийся с первой меткой. Он считался настолько сильным, что люди прозвали его мудрецом, но сам маг желал большего и он решил переродиться.
Не одно тысячелетие спустя на свет появился мальчик по имени Матиас Хильдесхаймр в теле которого и переродился великий маг. У мальчика на руке была четвертая метка — именно та о которой когда-то мечтал великий мудрец, но все вокруг считают эту метку самой слабой и не узнав парня, сразу торопятся жалеть его и записать его в число тех неудачников, которым не повезло пр рождении.
В возрасте 12 лет главный герой аниме "Сильнейший мудрец низшей эмблемы" отправляется в столицу для поступления в академию и ровно с этого момента начинаются его приключения.
По ходу своих приключений, Матиас встречает вещи, которые сам же создал в своей предыдущей жизни.